食用菌工厂的净化级别需要达到万级标准，高效过滤器出风口需要达到百级。这个净化标准是普通净化室，食用菌工厂的洁净室，一般物流、人流都较大，而且每天都要有人流和物流。根据经验，万级洁净室在静态状态下，是能够达到万级标准的，当生产的时候，如出锅、冷却、接种的时候尘埃粒子数量迅速增加，无法保证净化级别。

因此，食用菌工厂净化室净化级别提高到千级，而且要增加循环风量和循环次数，以保证在生产时动态的净化级别。

食用菌净化室一般不使用药物进行消毒，所以在设计净化室的时候，要安装紫外线灯管或臭氧发生器，用来消毒空间。

预冷室、冷却室、接种室的地面一定要考虑能否承受周转车车轮的碾压，地面一旦损坏很难修补。普通环氧自流平根本无法承受这种频繁的高强度的碾压，建议做新型耐磨地面，造价高一些，但是坚固耐用。

在食用菌洁净室循环风中保持10-15%的新风量，能够保证净化室空气清新，环境空气处于动态流动状态，环境指标更稳定。

初效过滤器和中效过滤器一般采用可以清洗材料制作，设计时要考虑方便清洗时拆卸和安装。

一般净化公司按照国家标准设计的风淋室风量都偏小，接种室人员流动带入的尘埃数量较多，所以建议加大风淋室的风量。